Derinkuyu, Kapadokya’nın binlerce yıl öncesine dayanan geçmişiyle bütünleşmiştir ve en çok yer altı şehriyle bilinir. Bölgede yerleşimin M.Ö. 2. binyıla kadar uzandığı tahmin edilmektedir; ilk olarak Hititler döneminde kayalara oyulmuş yaşam alanlarının yapıldığı düşünülür. Daha sonraki yüzyıllarda Roma ve Bizans dönemlerinde Hristiyan topluluklar, baskılardan korunmak amacıyla Derinkuyu’daki yer altı şehirlerini genişletmiş, çok katlı yapılar inşa ederek barınma, ibadet ve savunma ihtiyaçlarını karşılamıştır.