1899 yılında "Siyah Çoraplılar" adıyla bir araya gelen ve daha sonra 1902 yılında Kadıköy Futbol Kulübünü kuran Moda ve Kadıköy'deki gençlerin bu iki girişimi başarıyla sonuçlanamadı. Aynı gençler, 1907 yılında bir daha kapanmamak üzere Fenerbahçe Futbol Kulübünü kurdu.
Fenerbahçe'de ilk başkan Ziya Bey (Songülen), ilk genel sekreter Ayetullah Bey, ilk genel kaptan ve veznedar Necip Bey (Okaner) oldu. Fenerbahçe Futbol Kulübü, 1908 yılında dernekleşen ilk kulüp olma ünvanını elde etti.
Kuruluşunda renkleri sarı-beyaz olan Fenerbahçe Futbol Kulübü, 1909 yılında adını Fenerbahçe Spor Kulübü olarak değiştirdi ve bugüne kadar kullandığı sarı-lacivert renklerini aldı.
Türkiye Cumhuriyeti'nin kurucusu Mustafa Kemal Atatürk, 3 Mayıs 1918'de Fenerbahçe Kulübü Başkanını ziyaret etti. Bu sebeple her yıl 3 Mayıs, Fenerbahçe'nin kuruluş yıl dönümü olarak kutlanmaya başladı.
Fenerbahçe Spor Kulübü, 9 branşta faaliyetlerini sürdürürken, başarılı sonuçlara da imza atıyor. Sarı-lacivertli erkek ve kadın sporcular, futbol, basketbol, voleybol, atletizm, yelken, masa tenisi, boks, kürek ve yüzme branşlarında mücadele veriyor.
Futbolda 19 Süper Lig şampiyonluğu elde eden sarı-lacivertliler, Türkiye Kupası'nı 7, Türkiye Süper Kupası'nı ise 9 kez müzesine götürdü. Fenerbahçe, UEFA Şampiyonlar Ligi'nde çeyrek final, UEFA Avrupa Ligi'nde yarı final oynama başarısı gösterdi.
Basketbol branşında, erkeklerde Avrupa'nın en önemli kupasını kazanan ilk Türk takımı oldu. Kadın basketbol takımı da bu başarıyı tekrarladı.
Voleybolda, kadınlarda FIVB Kadınlar Dünya Kulüpler Şampiyonası'nda birinci, CEV Kadınlar Şampiyonlar Ligi'nde ise şampiyon oldu.
Amatör sporlarda ise, yelken, atletizm ve boks branşlarında önemli başarılar elde etti.
Fenerbahçe'nin tarihindeki 33 başkan arasında en uzun süre görev yapan isim Aziz Yıldırım oldu.
Fenerbahçe, son dönemde olimpiyatlara Türkiye'den en çok sporcu gönderen kulüp olarak öne çıkıyor.
Tekerlekli Sandalye Basketbol Takımı da Avrupa'da kupa kazanmayı başardı.