Çeyrek finaldeki eşleşmeler ise; Real Betis - Jagiellonia, Celje - Fiorentina, Chelsea - Legia Varşova ve Djurgarden - Rapid Wien şeklinde oluştu. UEFA Konferans Ligi’nde çeyrek final ilk maçları 10 Nisan’da, rövanş karşılaşmaları ise 17 Nisan’da oynanacak.

Son 16 turu rövanş maçlarında alınan skorlar şu şekilde:

  • Cercle Brugge (Belçika) - Jagiellonia (Polonya) (0-3): 2-0
  • Lugano (İsviçre) - Celje (Slovenya) (0-1): 5-4
  • Rapid Wien (Avusturya) - Borac (Bosna Hersek) (1-1): 2-1
  • Djurgarden (İsveç) - Pafos (Kıbrıs Rum Kesimi) (0-1): 3-0
  • Vitoria (Portekiz) - Real Betis (İspanya) (2-2): 0-4
  • Fiorentina (İtalya) - Panathinaikos (Yunanistan) (2-3): 3-1
  • Legia Varşova (Polonya) - Molde (Norveç) (2-3): 2-0
  • Chelsea (İngiltere) - Kopenhag (Danimarka) (2-1): 1-0

Fenerbahçe, Avrupa Ligi'ne penaltılarla veda etti.