Tam adı Ayten Gökçer Kaçmaz olan sanatçı, 26 Ocak 1940'ta Ankara'da dünyaya geldi. Henüz iki yaşındayken anne ve babası ayrılan sanatçının çocukluğu, Ankara'da, babasının ve kardeşlerinin yanında geçti.

Tiyatro yeteneğini fark eden annesinin yönlendirmesiyle 1952'de Ankara Devlet Konservatuvarı Bale Bölümüne başlayan Gökçer, annesinin isteği ve Muhsin Ertuğrul'un tavsiyesi üzerine 1957'de Ankara Devlet Tiyatroları Çocuk Tiyatrosu Bölümüne girdi. Usta oyuncu, ilk kez sahneye çıktığı ve müthiş bir heyecan yaşadığını söylediği, Mümtaz Zeki Taşkın'ın "Oyuncakçı Dede" eserinin ardından Eleneor H. Porter’ın "Pollyanna" piyesinde "hemşire" rolünü üstlendi. Devlet Tiyatrolarının 1958'deki sınavını kazanarak sanatçı kadrosuna geçen Gökçer, Devlet Tiyatrosunda ilk olarak Reşat Nuri Güntekin’in "Bu Gece Başka Gece" oyununda rol aldı.

Sanatçı, tiyatro oyuncusu ve yönetmen, eski Devlet Tiyatroları Genel Müdürü Cüneyt Gökçer ile 1964'te evlendi. Bu evlilikten Aslı adını verdikleri bir çocuğu dünyaya geldi.

Ayten Gökçer, sahnedeki ilk rollerinden biri olan "Dansöz Pandora" ile dikkati çekti. Canlandırdığı her karakter ile başarısını perçinleyen usta oyuncu, özellikle "My Fair Lady" eserinde Eliza Doolittle, **"Don Kişot"**ta Aldonza, **"Vanya Dayı"**da Yelena Andrayevna, **"7 Kocalı Hürmüz"**de Hürmüz, **"Master Class"**ta Maria Callas rolleriyle büyük beğeni kazandı.

Galatasaray’ın efsane futbolcusu ve Gol Kralı Metin Oktay’la başrolünü paylaştığı 1965 yapımı "Taçsız Kral" filmiyle sinemaya adım atan sanatçı, 1967'de Fikret Hakan ile "İçli Kız Funda", Cüneyt Gökçer ile de "501 Numaralı Hücre" adlı filmlerde rol aldı. Ancak daha sonra sinemadan daha çok tiyatroyu tercih etti. Gökçer, 1966'da "Kaktüs Çiçeği", 1970'te "My Fair Lady" oyunundaki rolü ile Sanatseverler Derneğinden "En İyi Sanatçı" ödülünü aldı.

Devlet Tiyatrolarında birçok oyunda oynadı. Televizyon dizilerini uzun yıllar tercih etmedi. 1988'de çekilen "Önce Canan" adlı dizide yer aldı. 1999'da "Yılan Hikayesi" dizisinde izleyicinin karşısına geçti. Başarılı sanatçı, Cüneyt Gökçer'in 2009'da vefatı üzerine Ankara'dan İstanbul'a yerleşti. Ferzan Özpetek'in 2016 yapımı "İstanbul Kırmızısı" filminde rol aldı.

Kültür Bakanlığı Üstün Hizmet Ödülü'ne 1966'da değer görülen, 1988'de ise Devlet Sanatçısı unvanını almıştır. Ayten Gökçer, 14 Mayıs 2024'te 84 yaşındayken vefat etti ve Zincirlikuyu Mezarlığı'nda eşinin yanına defnedildi.