Katoliklerin ruhani lideri ve Vatikan Devlet Başkanı Papa Franciscus’un Türkiye ile ilişkileri; sakin diyalog mesajları eşliğinde resmi bir ziyaretle başlarken, 1915 olaylarına dair Ermeni iddialarına destek vermesiyle gerildi ve Filistin-İsrail meselesindeki örtüşen tutumlar sayesinde yumuşadı. Papa Franciscus, Mart 2013'te Katolik Kilisesi’nin 266'ncı Papası olarak seçildi ve görevindeki ilk yıllarında Türkiye'yi ziyaret etti. 28-30 Kasım 2014 tarihleri arasında Ankara ve İstanbul’a gerçekleştirdiği seyahat, Türkiye'nin bölgedeki jeostratejik rolü dolayısıyla önemliydi. Ayrıca, Fener Rum Patrikhanesi ile yakınlaşma amacı taşıyordu. Papa, Ankara'da Cumhurbaşkanı Recep Tayyip Erdoğan ile görüştükten sonra İstanbul'a geçti ve burada Ayasofya ile Sultanahmet Camisi'ni ziyaret etti.

Papa'nın 1915 olaylarına ilişkin konuşması diplomatik bir krize yol açtı. 12 Nisan 2015 tarihinde, 1915 olaylarını "20. yüzyılın ilk soykırımı" olarak nitelendirmesi, Türkiye'nin sert tepkisine neden oldu. Türkiye, dönemin Vatikan Büyükelçisi'ni istişareler için Ankara’ya çağırdı ve ilişkileri maslahatgüzar seviyesine indirdi. Ancak Türkiye-Vatikan ilişkileri 2016'da bir yumuşama sürecine girdi.

Kudüs konusu, Türkiye ve Vatikan ilişkilerini yakınlaştırdı. 6 Aralık 2017'de ABD'nin Kudüs'ü İsrail'in başkenti olarak tanıma kararı, iki ülke liderleri arasında temasların sıklaşmasına neden oldu. Cumhurbaşkanı Erdoğan, 4-5 Şubat 2018 tarihlerinde Vatikan'a resmi bir ziyaret gerçekleştirdi ve Kudüs konusunu görüştü.

Son yıllarda, Papa Franciscus, Cumhurbaşkanı Erdoğan'ın Ukrayna ve Rusya’yı uzlaştırma çabalarını takdirle karşıladı. İki liderin temasları artarak devam etti ve Kudüs konusunda ortak tutum sergilediler. 1 Ağustos 2024’te, Paris 2024 Yaz Olimpiyat Oyunları'nın açılışında da bir araya geldiler.